Лаборатория была создана в 1970 году, и первой заведующей была Роальда Леонидовна Шляго, теперь старейший работник Академии наук со стажем 46 лет. Директора Института, сначала А.Ю.Ишлинский, а затем Д.М.Климов, всегда уделяли большое внимание развитию вычислительной базы Института, оснащению его новой техникой. В первый же год образования Института была запущена машина БЭСМ. В новом здании Института последовательно введены в эксплуатацию три ЭВМ серии ЕС, установлен первый в СССР матричный модуль МАМО. Была разработана и изготовлена интерактивная графическая система "Динамика". Сотрудники лаборатории активно участвовали в работах по автоматизации научных исследований. Вообще для лаборатории характерно тесное взаимодействие с другими лабораториями по внедрению и адаптации вычислительной техники для научных исследований.

Новый этап быстрого развития вычислительного центра ознаменовался в 1988 получением двух первых персональных компьютеров. В 1989 появилась ЭВМ коллективного пользования (аналог VAX), в 1990 - первая UNIX, в 1991 Институт одним из первых подключился к электронной почте, а в конце 1991 года создана локальная вычислительная сеть Эзернет, в 1996 году Институт получил непосредственный выход в Интернет, в 2001 году подключился к суперкомпьютеру Академии наук, в 2002 - выход в Интернет по оптоволоконному кабелю. В настоящее время к сети Института подключено около 300 персональных компьютеров.

Лаборатория вычислительной техники стала поставщиком кадров для Института. Заведующий лабораторией Исиков Николай Евгеньевич с 1994 года заместитель директора по общим вопросам. Системный программист Назарова Татьяна Юрьевна с 1-го апреля этого года главный бухгалтер Института. Программист Подлесная Наталия Игнатьевна - начальник отдела кадров. Системный программист Чугунова Галина Петровна - ведущий бухгалтер.